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葡萄球菌肺炎的首選藥物是要選擇針對葡萄球菌敏感的抗生素，近年來由于葡萄球菌對于青霉素的耐藥率可以達到90%以上。所以葡萄球菌肺炎選擇的抗生素，一般要選擇半合成青霉素或者是頭孢類抗生素，而在以上的基礎上聯合氨基糖苷類抗生素也有良好的療效。對于氨芐西林、阿莫西林與酶抑制劑的聯合制劑，對葡萄球菌肺炎也是有效的。對于耐藥的金葡菌的治療，例如耐藥金葡菌，也就是MRIC的治療，通常要選用萬古霉素、替考拉寧、利奈唑胺等藥物。葡萄球菌肺炎是由葡萄球菌引起的肺部感染性炎癥，葡萄球菌分為凝固酶陽性的葡萄球菌，主要指的是金黃色葡萄球菌。還有凝固酶陰性的葡萄球菌，例如表皮葡萄球菌和腐生葡萄球菌。?所以葡萄球菌引起的肺炎也是分類型的，選擇的藥物也不完全相同。對于耐藥的金黃色葡萄球菌，才會選用萬古霉素、替考拉寧、利奈唑胺等藥物。