沒有什么東西是稱的上是完全健康且對身體無害的，就比如我們知道的，即使是水果、蔬菜之類的綠色食品每天大量的吃，我們也是會生病的，那么像朱砂這種本身就含有微量的毒性物質，少量朱砂吃了會怎么樣，其實就像是上面說的沒有什么東西是無害的，還有本身是藥三分毒，所以其實為了治療，少量食用朱砂是沒有問題的，但只能少量且不能經常吃。

現代研究表明，朱砂內服過量可引起毒性。由于無機汞在人體內的吸收率為5%，甲基汞的吸收率可達100%。朱砂在厭氧有硫的條件下，PH7、溫度37℃的暗環境中與帶甲基的物質相遇均能產生甲基汞，而人體腸道正具備這些條件，故內服朱砂制劑增加了中毒機會。朱砂在臨床上的主要中毒表現為，神經系統，失眠多夢，記憶力減退，頭痛頭暈，手腳麻木等;消化系統，初期表現為惡心，嘔吐，咽喉腫痛，食欲不振，重者可出現消化道出血;泌尿系統，常表現在中毒后期，血壓下降，心率紊亂或中毒性心肌炎等。汞吸收入血后通過生物膜進入紅細胞與血紅蛋白的巰基結合，可侵害腦細胞、胎兒、心、肝、腎等，還可抑制多種酶的活性，嚴重時發生急性腎功能衰竭而死亡。

雖然朱砂是含有毒性的，但是朱砂外用具有解毒功能，與雄黃、山慈菇、麝香、千金子等配伍，外涂治瘡毒腫痛，與冰片、硼砂、玄明粉等吹喉，治療口舌生瘡、咽喉腫痛等癥。朱砂屬安神類藥、性味、寒、甘、歸心經、有毒、主治、清心鎮驚、安神解毒、每次不超過一克、也可外用。少量是沒問題的、注意不可超量久服，以防汞中毒。不可火煅，因見火后則析出水銀，有劇毒。