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小三陽代表患者感染乙肝病毒，HBV-DNA的數值代表病毒載量，其數值越低越好。不同實驗室的載量正常臨界值不同，部分是500IU/ml，部分是50IU/ml或20IU/ml。對于小三陽HBV-DNA陰性，也不能代表體內完全清除乙肝病毒，即使血液中檢測不到HBV-DNA，但肝組織中可能存在HBV-DNA。在免疫力低下時應用免疫抑制劑等，HBV-DNA可以再次陽性。所以臨床上應用抗病毒治療時，HBV-DNA即使轉陰，也要堅持抗病毒治療。如果停止口服核苷類似物，HBV-DNA有反彈風險。