1、用于治療崩漏。不論是月經來淋瀝不止，或是久漏成崩，流血量多勢急，只要屬血熱者，都可應用茜草根(炒炭)，配海螵蛸、荊芥炭、白術、續斷等作為基本方，再隨證加減;如屬血崩虛證，則配固澀藥如龍骨、牡蠣，補益藥如白術、黃芪等以固澀止血、健脾攝血，方如固沖湯。

2、治療熱證血痢，有涼血止血作用，常配川連、黃芩、地榆等同用，方如茜根散。取當歸、丹參、牛膝等，研末服或水煎，黃酒沖服。

3、治老年慢性氣管炎。近年來，臨床觀察和實驗室研究發現，茜草根配含羞草根、紅背葉(加味含紅合劑)治慢性氣管炎有較好的止咳、祛痰、平喘作用。其中主要有效藥物雖為含羞草根，但茜草根也有鎮咳和抗菌作用。

4、治熱證吐血、衄血，配生地、白及、側柏葉等，但不宜用于血虛吐衄。

5、治跌打損傷，由于憋氣過度而致內有積瘀者，常配澤蘭、赤芍、紅花等活血祛瘀藥同服。