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腦部的彩超跟核磁的區別很大，具體區別如下：1、彩超：頸部血管超聲主要可以觀察頸部動脈粥樣硬化斑塊、評估頸部血管狹窄情況，及對血流情況進行評估。如是顱內經顱多普勒，可以對大血管如大腦中動脈、大腦前動脈血流速度、血流方向進行監測，此外超聲還可以對微栓子進行監測及評估，腦血流速度、血管狹窄及血管痙攣都可以進行評估；2、核磁：腦核磁可以對腦血管形態，如是否有些局部狹窄進行顯示。除此之外，還可以對腦的結構進行顯示，這是血管超聲做不到的。如核磁不同序列，T1加權像可以看到正常的腦組織結構，T2會對病變結構進行顯示，FLAIR成像可以對脫髓鞘、腦梗的病灶顯示更清楚，T2start或SWI對于腦內出血、陳舊出血特別敏感。核磁和超聲在顯示的不同方面各有優劣，需要結合檢查的目的，來進行特征性選擇。