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心臟核磁和心臟彩超檢查，根據心臟疾病的不同類型，以及病因診斷，有不同特點和長處，無法互相取代，都是心血管內科對于心臟病進行診斷和鑒別診斷重要的兩種方法。心臟核磁主要是對心肌疾病的診斷，特別是對于心肌疾病病因的診斷。若發現心臟明顯擴大、心肌肥厚或者出現缺血等導致心肌病，此時通過心臟核磁，比較有特點的心肌疾病，在心肌核磁上有顯影和顯像，比心臟彩超在判斷病因方面具有優勢，但心臟核磁檢查時間較長。而心臟彩超可非常直觀地判斷心臟結構功能，可短時間內給心臟病變做出大致判斷，如心臟的瓣膜性疾病等。所以在臨床相關檢查中先進行心臟彩超檢查進行篩查，若病因不清或者尋找鑒別因素時，可進行心臟核磁。