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對大多數內科或內分泌醫生而言，甲功三項主要是指FT3、FT4、TSH的水平。因為甲亢或甲減患者調整藥物時，最基本的三項就是FT3、FT4、TSH的水平，能夠了解、評定甲亢控制指標、甲減替代劑量是否合適。但懷孕時婦產科進行篩查時，甲功三項主要指TSH、FT4、TPO的水平，主要傾向于懷孕期孕婦的甲功是否會對胎兒造成影響。所以，不同的專業組可能對甲功三項的要求不同。內分泌科更側重在甲亢、甲減患者功能替代、抑制情況。甲亢患者在檢查的時候可能還會加上TRAb或TSAb，主要是更好地觀察甲亢的控制指標和復發指標，甲減患者進行基本的三項檢查即可。孕婦主要傾向胎兒健康、母體健康或右甲狀腺素的替代劑量是否合適，主要是檢測FT4、TSH、TPO的水平，進行初步篩查以及藥物劑量的調整，都傾向于這三項。