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菌群失調通常指陰道內菌群失調，和HPV感染沒有關系。陰道內菌群失調，通常跟下列因素有關：1、不正確護理：在日常生活中，有人認為陰道內分泌物都是不利因素，所以每天用潔爾陰或者其他護理液沖洗陰道。反復沖洗之后，就會使陰道內環境遭到破壞，菌群失調，致病菌繁殖，反倒引起陰道局部的炎癥性反應；2、糖尿病：可能患有糖尿病，導致體內或陰道內糖原增高，引起體內菌群失調，導致大量念珠菌繁殖；3、長期應用抗生素：可能跟長期應用抗生素有關。如果長期應用抗生素，會使致病菌得到抑制而被殺滅。同時有益菌也會被抑制或殺滅，容易導致菌群失調，引起相應的臨床癥狀。在婦科中，最常見的是容易引起念珠菌感染。所以菌群失調和HPV感染沒有關系，而HPV感染屬于病毒感染。