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目前可以采取以下幾種方式檢查腸道菌群是否失調，具體如下：1、糞便桿菌球菌比例檢測：可以大致判斷是否存在腸道菌群失調，目前較為常用。通常情況下，桿菌、球菌的比例是(8-10)∶1，如果患者桿球比低于正常水平，可能存在腸道菌群失調。而更加嚴謹、準確的檢測方法，主要是通過科學研究的方式進行，目前臨床上尚未開展，因為這些方法對實驗儀器要求比較高，費用也比較高，不適合在臨床上大規模使用；2、其它方法：患者還可以通過對糞便16S蛋白進行檢測，以及通過基因組檢測等方法進行判斷，還可以進行糞便培養，如果培養出現致病菌，通常提示腸道菌群存在失調的情況。出現腸道菌群失調一般存在誘因，比如患者因為其它疾病使用抗菌素，尤其是使用廣譜抗菌素，使用時間較長或患者本身體質比較弱、免疫狀態比較差，以及久病的患者，平素營養狀況較差，無法正常飲食，都是腸道菌群失調的危險因素。如果存在上述危險因素，患者又出現腸道功能紊亂的表現，例如腹瀉等，通過常規治療效果比較差，需要考慮存在腸道菌群失調的情況。