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兒童發燒的細菌感染和病毒感染區別，單從癥狀方面不好區別，可能還需配合體格檢查和實驗室的輔助檢查，進行綜合判斷，具體如下：1、體格檢查：如果體格檢查兒童存在發燒，同時醫生檢查發現扁桃體化膿，通常考慮為細菌感染的可能性較大。同時如果發現只是普通急性發燒，兒童存在咽喉腫痛、扁桃體充血，但未發生化膿，此時通常考慮病毒感染可能性較大；2、實驗室輔助檢查：如血常規、C反應蛋白、降鈣素原等方面檢查，如果查血常規發現白細胞顯著增高，并且是以中性粒細胞增高為主，C反應蛋白、降鈣素原等炎癥因子明顯增高，此時通常考慮細菌感染可能性較大。如果兒童反復發燒，還會通過進行血培養等檢查。如果血培養為陽性，存在大量細菌生長且反復發燒，此時通常考慮發生細菌感染。如果血常規檢查白細胞正常，以淋巴細胞升高為主，同時血培養病毒抗體呈陽性，此時通常考慮為病毒感染的可能性較大。