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同型半胱氨酸低一般沒有相關臨床癥狀，同型半胱氨酸是體內蛋白質代謝產物，高同型半胱氨酸有相關臨床意義，比如機酸代謝異常，可能使同型半胱氨酸增加，比如兒童最常見甲基丙二酸血癥或甲基丙二酸尿癥。這部分機酸代謝異常孩子，常合并高同型半胱氨酸血癥，所以同型半胱氨酸水平明顯增加。如果同型半胱氨酸正常值范圍內或稍低，一般沒有相關特殊影響，必要時可以攝入充足蛋白質或必需氨基酸，通過食物補給或必需蛋白質和氨基酸攝入，可以改善同型半胱氨氨酸低。同型半胱氨酸明顯升高時應予以重視，因為與身體內各系統、臟器功能相關，如原發性高血壓或代謝性疾病，可能會合并高同型半胱氨酸血癥。