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亞急性感染性心內膜炎常見的病原體，和急性感染性心內膜炎常見的病原體不一樣。亞急性感染性心內膜炎常見的病原體是草綠色鏈球菌，而急性感染性心內膜炎常見的病原體是金黃色葡萄球菌，兩種細菌在侵襲力、致病力，以及毒力方面是有所差異。亞急性感染性心內膜炎的常見病原體草綠色鏈球菌，致病力弱于金黃色葡萄球菌。當血液循環中的草綠色鏈球菌隨著血液循環，定殖在病變的心臟瓣膜上的時候，通常會形成一些贅生物。當這些贅生物脫落的時候，可以隨著血液循環定殖在重要臟器上，比如這些贅生物包含病原菌草綠色鏈球菌，如果定殖在肝臟上，通常會導致肝膿腫。如果定殖在脾臟上，也會導致脾膿腫，如果定殖在腦實質上，會導致腦膿腫。