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耐藥性肺結核的診斷比較困難，一般有以下幾點： 1、耐藥性肺結核完全要靠實驗室診斷，一般要等到痰抗酸桿菌培養結果； 2、藥敏檢測相對時間比較長，痰培養加結核菌藥敏出來以后，至少需要兩個月時間，診斷比較困難，完全依靠實驗室診斷； 3、對部分結核病人，用一線藥物效果不好，復查痰一直是陽性，還有CT片子顯示某些肺病灶吸收不明顯，痰菌一直是陽性，臨床上不排除是耐藥性肺結核。這時也可以根據病人情況，合理調整，先按耐藥方案治療，診斷為耐藥性結核病。