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細菌性痢疾的病原菌是志賀桿菌。一般根據志賀桿菌表面抗原的不同，分為4個菌，第1痢疾志賀菌，第2福氏志賀菌，第3宋內志賀菌，第4鮑氏志賀菌。我們國家引起痢疾的最主要是福氏志賀菌和宋內志賀菌。在多年以前主要是福氏志賀菌，是引起國家細菌性痢疾最多見的一個志賀菌。但隨著國家衛生條件的改善，痢疾桿菌的志賀菌有所發生變化，目前引起痢疾主要的志賀菌，是宋內志賀菌。現在志賀菌引起的細菌性痢疾，比福氏志賀菌引起的病情輕，引起慢性化的幾率相對比較少，所以現在引起的細菌性痢疾，基本上很少能夠見到典型的細菌性痢疾的表現。典型表現應該是患者出現發熱、腹痛、腹瀉、排黏液膿血便、左下腹出現壓痛，同時會出現里急后重，也就是下墜的感覺。但是宋內志賀菌引起痢疾的上述典型表現，相對很少能夠見到，表現的癥狀比較輕。可能有輕微的發熱、腹痛、排黏液便，很少能夠見到典型的膿血便。所以目前國家主要引起細菌性痢疾，應該是宋內志賀菌的細菌性痢疾，還有少部分是福氏志賀菌，引起的細菌性痢疾。