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腫瘤發生腦轉移時就涉及到轉移的鑒別診斷，除腫瘤本身鑒別以外還要與其它良性病變進行鑒別。影像學檢查比如腦部CT、核磁共振等檢查中會存在特征性改變，腦部感染病灶發生局限性改變以后會形成慢性膿腫，因此也需要與腫瘤進行鑒別；而對于特殊的情況，比如腦部的寄生蟲感染，如囊蟲或者包蟲病，甚至其它的寄生蟲，可形成多個獨立的病灶，這些病灶有時候也需要與腫瘤進行鑒別，上述均為非腫瘤的情況。 腦部占位中腫瘤鑒別在于占位效應是源自于腦部本身發生的腫瘤，即是原發性腫瘤，還是其它器官腫瘤轉移到腦部。單發的腫瘤可能在沒有原發灶，或者是其它身體部位發現腫瘤的情況下也不能除外是原發性腫瘤。腦部原發性腫瘤也有不同的種類，最常見的腦膠質瘤、腦膜瘤等。膠質瘤大部分是惡性腫瘤，而腦膜瘤大部分是良性。轉移瘤和原發的腫瘤還是存在差別，轉移很可能不止存在一個病灶，隨著疾病的進展，轉移灶越來越多，能夠證實可能為轉移的腫瘤。 而原發腫瘤也有治療的方式，原發腫瘤大部分會選擇手術進行切除，而轉移的腫瘤則可能選擇局部放射治療或者其它特殊的治療，包括全身治療等。