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肝細胞癌患者的血液檢查以甲胎蛋白檢查為主，肝細胞癌患者的甲胎蛋白可以升高，但也不是所有患者都會升高，70%-80%患者的甲胎蛋白會升高。對于膽管細胞癌和混合性肝細胞癌，甲胎蛋白的水平可以正常，所以甲胎蛋白水平高低不完全代表肝癌。 肝功能異常時，轉氨酶明顯升高，甲胎蛋白也可以升高，隨著肝功能恢復正常，甲胎蛋白會恢復正常。從另一個角度來講，說明肝細胞的再生比較活躍，預后比較好。因此，甲胎蛋白的水平增高不一定是肝癌。