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乙肝表面抗原轉陰，在臨床癥狀上患者沒有任何感覺或先兆。表面抗原轉陰前，表面抗原水平逐漸下降，同時在表面抗原轉陰前，先要有e抗原轉陰。對于大三陽患者而言，先是HBV-DNA(乙肝病毒基因)消失，然后是e抗原轉陰，或出現e抗原血清轉換，即e抗原轉陰、e抗體出現。然后表面抗原水平逐漸下降，降到正常以下才是轉陰。所以乙肝表面抗原轉陰的先兆，是必須有HBV-DNA轉陰，然后有e抗原轉陰，或e異抗原的血清轉換，才出現表面抗原轉陰。伴隨著表面抗原轉陰，患者肝功能是穩定的狀態，肝功能轉氨酶是隨著e抗原下降，轉氨酶也由不正常恢復正常。所以隨著e抗原轉陰，患者肝臟功能、肝細胞損傷程度會逐漸好轉，然后病毒逐漸消失。但e抗原轉陰并不能說明乙肝病毒完全消失，對于表面抗原轉陰后的乙肝患者，肝細胞中仍然有微量乙肝病毒。所以即便是表面抗原轉陰，也需定期復查乙肝五項。