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膠質增生與膠質瘤的區別在于前者為良性，而后者為惡性腫瘤。若組織存在明顯的異型性與惡性特征時，則為瘤；若其無異型性時，可由其他原因造成，如腦部腫瘤的膨脹性增長，從而壓迫周圍腦組織，繼發反應性增生。另外，當患者的膠質增生為惡性且單克隆性時，便可稱為膠質瘤干細胞。臨床上鑒別膠質增生與膠質瘤的方法較多，其中包括分子生物學法、形態學觀察法。