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磁共振頭部檢查屬于較常見檢查方式，對于顱腦疾病檢查應用較為廣泛，具有軟組織分辨率高的特點，可以發現微小出血灶、小血管畸形、隱匿性損傷等，可以觀察到神經纖維束走行，腦波譜可以輔助病變定性診斷等。與CT檢查相比較敏感，可以發現早期病變，例如急性腦梗死。CT一般需要24小時以上才可以觀察到病變密度改變，磁共振最短可以在半小時左右發現異常。 磁共振檢查適應人群范圍廣泛，例如幼兒檢查，可以評估腦發育、髓鞘發育情況等。按疾病種類劃分可以檢查腦腫瘤性病變、腦炎性病變、腦白質性病變。腦血管性病變例如腦缺血、腦梗死，腦先天性異常都可以診斷。還可以較好發現腦血管異常、顱神經走行異常，動脈瘤、動脈畸形等。