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志賀桿菌也稱志賀菌，其感染引起的痢疾，主要應用抗菌藥物治療。如果腹痛明顯，可以應用解痙藥物，排便次數多也可以補水治療。抗菌藥物首選喹諾酮類藥物，比如可以應用環丙沙星、諾氟沙星、左氧氟沙星。如果患者不能應用喹諾酮類的藥物，比如兒童，也可以選擇頭孢類的藥物，一般選擇二代頭孢，也可以應用三代頭孢。對于能夠口服的患者，盡可能口服治療，對于不能夠口服的患者，也可以應用靜脈的抗菌藥物治療。對于志賀菌引起的痢疾，一般不主張應用止瀉劑。志賀菌引起的痢疾一般排便次數比較多，主要是黏液，或者局部滲出的膿血，很少有糞質。這些毒素以及炎癥滲出不主張應用止瀉劑，否則不利于細菌以及毒素的排出。如果患者有明顯腹痛，可以應用解痙攣的藥物，比如654-2即消旋山莨菪堿或者顛茄片。對于志賀菌引起的痢疾，通常引起脫水的情況不是很多見，但也要注意，如果患者排便次數非常多，盡量多補充水分，還可以補充鹽分。最好選擇口服補液鹽，既可以補水，也可以補充鹽分。對于痢疾桿菌的感染者，應該采用足夠療程抗感染治療，否則也可以引起慢性菌痢。