兩個月寶寶睡覺搖頭晃腦、手腳亂動可能有以下原因：
1. 寶寶缺鈣或維生素D缺乏性佝僂病。如果寶寶出現煩躁、夜啼、搖頭晃腦、夜間多汗、手腳亂動等癥狀，可能是缺鈣導致的。如果寶寶出現多汗、夜啼、搖頭、煩躁、睡眠不安、手腳亂動等癥狀，可能是維生素D缺乏性佝僂病導致的。家長可以在醫生的指導下給寶寶服用藥物來補充鈣質或維生素D，同時適當帶寶寶曬太陽。
2. 寶寶白天活動量過大，導致夜間睡眠時處于淺睡眠狀態。家長可以適當減少寶寶白天的活動量，以改善夜間睡眠質量。
3. 房間溫度過高、被褥蓋得過厚，寶寶感覺過熱。家長可以適當降低房間溫度，減少被褥厚度，以改善寶寶的睡眠環境。
以上是兩個月寶寶睡覺搖頭晃腦、手腳亂動的原因和對應的解決方案，家長可以根據情況，進行相應的調整和處理。
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