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判斷腫瘤惡性度的高低有較多依據，最主要的依據是腫瘤的分化程度。通常腫瘤按照分化程度分為高分化腫瘤、中分化腫瘤以及低分化腫瘤，還包括未分化腫瘤，通常高分化腫瘤惡性程度較低，未分化腫瘤惡性度較高。有些病理類型也提示腫瘤惡性度較高，比如肺癌在臨床上按病理類型，分為腺癌、鱗癌以及小細胞肺癌，小細胞肺癌相比肺腺癌和鱗癌惡性度較高。此外，乳腺癌的免疫組化也幫助判斷惡性度的高低，比如三陰乳腺癌的惡性度較高，通常患者發現腫瘤時，多數為晚期，臨床上有效的手段較少，腫瘤長得較快，此腫瘤就認為屬于高度惡性腫瘤。