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檢查腦部疾病選擇CT還是核磁共振檢查，需要依據疾病而定，常見如下：1、CT檢查：患者檢查腦出血、蛛網膜下腔出血等出血性病變、急性出血，進行CT檢查較好；2、核磁共振檢查：除以上疾病類型外，進行核磁共振較好，尤其病變位于腦干部位。CT檢查時該位置骨頭偽影較多，分辨率較低，易出現誤差。核磁共振是三維立體結構，CT是平面結構，無論腫瘤、缺血性腦血管病，進行DWI或TWI能夠發現數小時內急性期腦梗，磁敏感成像對于陳舊性出血，也可以較好觀察。