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核磁共振是否能夠檢查出腦發育遲緩，取決于腦部形態改變，具體如下：1、部分腦發育不良存在形態學改變，如腦體積縮小、腦組織存在缺陷，可通過核磁共振檢查發現；2、通過核共振功能成像，可發現代謝紊亂，以此找出部分腦發育不良的證據；3、部分腦發育不良在形態學上沒有明顯改變，或其改變無法通過核磁共振檢測出，則可通過其他檢測方法，如腦電圖、CT，發現其中的代謝紊亂。所以核磁共振對檢查腦發育不良不是完美的檢查工具，通常還需結合臨床表現，通過腰穿、腦電圖，以及各種評估，加以綜合考慮。此外還存在一種情況，患者在核磁上可能存在形態學缺陷，但從功能上，患者無任何異常，因此不能單純從核磁表現來認定該患者有腦功能發育不全。