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病毒變異是指病毒基因類型發生改變，病毒變異對臨床、對公共衛生有一定的影響，不同的變異有不同的影響。部分病毒變異以后復制能力減弱，另一部分病毒變異以后復制能力增強，同時傳染性也增強。甚至部分病毒變異以后，原來的疫苗可能失去作用。判斷病毒感染后是否變異，可以采取檢查方法，如做病毒基因檢測即基因測序。病毒變異可能會影響藥物治療效果，如果能根據不同的變異位點制定不同的藥物策略，也有可能使治療效果得到進一步提高。