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抗甲狀腺過氧化物酶抗體升高常見于自身免疫性甲狀腺疾病，還可以見于某些自身免疫性疾病，如系統性紅斑狼瘡、類風濕關節炎等疾病。甲狀腺過氧化物酶主要是在生物合成T3和T4的過程中催化甲狀腺球蛋白酪氨酸碘化。甲狀腺過氧化物酶抗體起到直接對抗甲狀腺過氧化物酶的作用，是甲狀腺組織的自身抗體。甲狀腺過氧化物酶抗體與自身免疫性甲狀腺疾病的發生發展密切相關，也是診斷自身免疫性甲狀腺疾病的首選指標。因為甲狀腺過氧化物酶抗體的靈敏性、特異性最好，所以更可靠、更有臨床意義。甲狀腺過氧化物酶抗體升高主要見于慢性自身免疫性甲狀腺炎，又可分為慢性淋巴細胞性甲狀腺炎、無痛性甲狀腺炎以及產后甲狀腺炎。另外，抗甲狀腺過氧化物酶抗體升高還可見于Graves病，也稱為毒性彌漫性甲狀腺腫，是甲亢的最常見原因。