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甲狀腺抗過氧化酶抗體是甲狀腺的一個自身抗體，它是自身免疫性抗體，跟甲狀腺的自身免疫性疾病是相關的。抗體實際上多數是通過病人化驗血的抗體檢查發現的。一般情況下多數病人是在門診檢查過程中發現甲狀腺有腫大或甲狀腺有質地相對比較硬，或通過超聲發現甲狀腺有一些結節或彌漫性病變，再找醫生檢查。醫生多數給病人開查甲狀腺的兩個抗體，甲狀腺球蛋白抗體和甲狀腺微粒體抗體。事實上甲狀腺過氧化物酶抗體就是甲狀腺微粒體抗體的活性成分，這個抗體升高代表自身免疫性甲狀腺炎，自身免疫性甲狀腺炎現在基本上多數就是橋本氏病(慢性淋巴細胞性甲狀腺炎)，它們是診斷橋本氏病的重要抗體。