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新生兒心臟未閉合原因很多，可能屬于生理性表現，也可能屬于病理性表現。剛出生的新生兒可能有卵圓孔未閉或者小型房缺、動脈導管未閉，均屬于常見情況。通常可能在幾個月或者1歲內自行愈合，無需過分干預。 但部分可能為病理性，遺傳因素占一定比例，基因、染色體方面問題，如單基因病變、多基因病變、染色體畸形等，臨床最常見21-三體即先天愚型、18-三體綜合征等，很多都合并心臟方面的問題。此外，可見于非遺傳因素，主要由各種理化因素引起，如各種輻射、空氣污染、農藥、殺蟲劑、妊娠期感染，特別是懷孕2-8周，為人體各臟器發育的關鍵時期，各種感染均可能造成比較嚴重的問題，尤其是心臟問題。此外，母親妊娠期患病，如甲亢、高血壓、糖尿病等，以及藥物不當應用，也會增加胎兒先心病發病的風險。所以，對于想擁有健康寶寶的母親而言，孕前仔細備孕以及孕期防護均比較重要。