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乙肝病毒感染的恢復期，一般指的是患者肝臟的損傷逐漸修復，肝細胞逐漸恢復再生，肝臟功能的指標逐漸恢復正常。但是乙肝病毒的一些標志物仍然呈陽性，病毒可能仍然有少量的復制。這種情況化驗通常表現為乙肝5項里的表面抗原還沒有陰轉，但是表面抗原的定量在逐漸下降。比如在感染的高峰期，患者表面抗原達到上百，甚至上千、上萬，而在恢復期逐漸下降。通過定期復查，每2周一查或者每1周一查，表面抗原從上千會逐漸下降到上百，甚至從上百下降到幾十，這是一個恢復期的表現。另外乙肝的表面抗體逐漸出現，以及對患者的HBV-DNA，也就是乙肝病毒的載量，在高峰期可以達到10的幾次方以上，而在恢復期逐漸下降，甚至陰轉。DNA的陰轉是早于表面抗原的陰轉，但是個別的情況下，可能表面抗原先陰轉，后DNA陰轉。在恢復期的末期，表面抗原陰轉，表面抗體就變成陽性，這樣感染者后期獲得免疫力。除了表面抗體陽性之外，患者的核心抗體和E抗體通常也是陽性，稱為三抗體陽性。