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目前還沒有針對治療甲狀腺過氧化物酶抗體增高的特效藥物，所以對于上述指標的增高，醫生能做的是告訴患者，其對身體的影響以及定期復查。如果患者已經出現甲狀腺功能減退，可以補充甲狀腺素，如果還沒有甲狀腺功能減退，可以繼續觀察，等到將來甲狀腺功能出現問題，再根據這時的甲狀腺功能，采取相應的治療措施。甲狀腺過氧化物酶抗體的出現，是由于身體的免疫系統紊亂出現針對于身體正常酶的抗體，會影響到甲狀腺過氧化物酶的活性。甲狀腺過氧化物酶是甲狀腺素合成中較為關鍵的酶，活性被降低時，會出現甲狀腺素合成減少，因此患者易出現甲狀腺功能減退，同時伴有頸部甲狀腺的腫大，通常見于橋本氏甲狀腺炎。因此也可以說甲狀腺過氧化物酶抗體是橋本氏甲狀腺炎比較特異性的免疫標志物之一。