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肺部肉芽腫的原因較多，不同原因肉芽腫所造成的危害不同，主要有以下幾點：1、感染性肉芽腫：感染性肉芽腫主要是結核和非結核分枝桿菌、真菌等病原體引起的炎癥，均可造成肉芽狀性炎癥，上述病原體造成的感染較為嚴重，如果不及時治療，感染可擴散到全肺而引起肺纖維化、空洞，以及肺結構改變，可能影響肺部功能，引起全身炎癥反應綜合征，甚至引起死亡，因此危害較大；2、非感染性肉芽腫：主要包括韋格納氏肉芽腫、肉芽腫性多血管炎，以及隱源性機化性肺炎(COP)、結節病等。雖然上述疾病不是感染所引起，但肉芽腫性炎癥的所有特征均可具有，主要是由于變態反應性疾病或感染誘發后，身體引起的變態反應性反應，在肺部進行炎癥反應，而引起肺部增生、結節以及形成大的腫塊硬，還有些疾病可能引起縱隔淋巴結腫大和肺內淋巴結腫大。肉芽腫性炎同樣可能引起肺纖維化，可能毀壞肺部血管而引起肺動脈高壓，嚴重時同樣可引起呼吸衰竭。非感染性肉芽腫同時也是全身炎癥反應綜合征的一個方面，也可能引起全身炎癥反應、血管以及其它地方的肉芽腫性炎。因此所以發現肺部肉芽腫后，患者需及時治療，如果不能及時治療，同樣可能損害健康、損害肺功能，還可能損害生命安全。