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臨床上初步診斷胃食管反流性疾病，主要通過以下三個方面。首先評估患者是否具有典型的胃食管反流性的癥狀，包括反酸和燒心。通常還會評估胃食管反流性疾病的量表，來判斷胃食管反流性疾病方面的概率。同時常規運用PPI的實驗，按照正規劑量運用質子泵抑制劑治療8周時間，來評估患者典型癥狀的緩解程度。通過以上三個方面，進行初步診斷，患者是否患有胃食管反流性疾病。臨床上，還會綜合考慮到胃鏡、24小時測酸以及食管測壓的檢查。胃鏡可以判斷患者是否患有反流性的食管炎，同時還可以觀察并評判食管的其他疾病，包括是否合并有Barrett食管等。24小時測酸最能夠準確反映患者胃酸反流的類型以及程度，在臨床診斷上最具價值和意義。食管動力的測定，可以排除患者是否患有功能性的食管疾病。