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核磁共振能夠發現較大的肺實性結節，但小肺結節，尤其磨玻璃密度很淡的肺結節，磁共振根本沒法發現。肺結節檢查首選為CT檢查，磁共振在肺結節診斷以及檢出率方面不如CT。很多老百姓存在誤區，可能覺得設備越貴檢查效果越好，其實不然。在臨床應用中每個設備均有適應性，磁共振對軟組織分辨率好，比如在滑膜、血管、神經系統，以及肌肉、肌腱、韌帶、透明軟骨方面分辨率較高。 對疾病判定磁共振有很大優勢，CT在觀察骨頭、肺、出血等病變，具有優勢，兩者檢查可以優勢互補。肺部磁共振只能作為CT成像的補充，使用肺部磁共振檢查通常用來評估病變是否侵犯縱隔、是否侵犯心臟、胸壁。另外，也可以評估縱隔淋巴結情況，但肺結節在診斷上確實很少使用磁共振進行檢查。