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乙型肝炎病毒DNA檢測的主要是乙型肝炎病毒的脫氧核糖核酸。乙型肝炎病毒的脫氧核糖核酸，主要是反映乙型肝炎病毒在體內活躍，也就是繁殖或者復制的程度。如果HBV-DNA，也就是乙型肝炎病毒DNA滴度越高，病毒在體內的復制的程度越高。如果是陰性，代表乙型肝炎病毒DNA，乙型肝炎病毒脫氧核酸核酸在體內的復制比較低水平，甚至沒有。乙型肝炎病毒DNA作為判斷患者乙型肝炎病毒在體內的復制程度，用來監測用藥和指導治療。因此在臨床上，檢測乙型肝炎病毒DNA是很重要的環節，不能單純認為乙型肝炎病毒，是大三陽還是小三陽。