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導致轉氨酶偏高的主要原因是各種病因導致肝損傷所致，少部分是由于劇烈運動之后，出現的肌肉損傷，或者是嚴重的心臟疾病，如心肌梗塞而引起轉氨酶的升高。轉氨酶主要是存在于肝細胞中，所以任何原因導致的肝損傷，都有可能會出現轉氨酶的異常升高。引起肝臟受損最常見的原因包括肝炎病毒感染，表現為急性或慢性肝炎，嚴重的肝病還可以進展成為肝硬化，甚至是肝功能衰竭。此時轉氨酶反而不會出現異常的顯著升高，原因在于正常的肝細胞已經所剩無幾，飲酒、藥物或者某些化學毒素會引起肝細胞的受損，表現為轉氨酶升高、嚴重的脂肪肝，繼而出現脂肪性肝炎，也可以表現為轉氨酶的升高，而某些自身免疫性肝臟疾病也會出現由于免疫過強或者是免疫功能異常，而引起肝臟受損。肝臟相鄰的器官主要是膽道，膽道炎癥、膽道梗阻也會引起轉氨酶的升高。