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近親婚配所生育的子代并不一定都會出現非常嚴重的問題，不過出現染色體、基因疾病的風險確實會大大增加，可能會出現比較嚴重的染色體和基因疾病。因為從遺傳學的角度上來講，人類的染色體一共是有23對，其中22對為常染色體，1對為性染色體。常染色體每對會有2條，其中1條染色體來源于父系，1條染色體來源于母系。性染色體男性為xy，x來源于母系，y染色體來源于父系，女性的后代性染色體為xx，也分別來自于父系和母系。由此可見，子代的染色體本身是23對，其中一半是來源于父系，一半來源于母系。正是因為這樣全新的染色體結合，才構成了一個新的個體。如果是近親婚配，很有可能在近親的父系和母系中，可能會攜帶有相同的致病基因。之所以他們可能并沒有非常明顯的臨床表現，是因為有很多疾病常常呈現著常染色體或者性染色體的不同的遺傳方式。如常染色體的隱性遺傳，只有1對染色體中2個來自父系、母系的染色體同時出現問題，子代才會出現非常嚴重的臨床癥狀。但如果是近親婚配，很有可能父系帶有一半的染色體有問題，另外的染色體沒有問題，所以父系可能外觀表征學是非常正常的一個個體。同樣的道理，母系也有可能是外觀表觀學上的非常正常的個體。可是都有可能會將致病基因或者是致病的染色體遺傳給后代，后代就大概率會同時攜帶父系和母系來源的致病基因。這種狀況下將會大大增加后代發生非常嚴重的染色體疾病、基因疾病，導致非常嚴重后果的風險值。正是因為這樣的風險以及遺傳學的因素，所以禁忌，盡量不要近親結婚，而且從法律的規定上來講也不應該近親結婚。