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機體缺碘可導致甲狀腺激素合成原料減少，此時最主要的危害是容易產生甲狀腺功能減退癥。臨床上見得最多的就是地方性甲狀腺腫伴甲狀腺功能減退癥。因為在一些地區遠離海邊，而碘主要存在于海產品中，包括海鹽、海魚、海蝦、海菜等，所以食物中含碘量比較少。此外，碘是機體合成甲狀腺激素的原料，碘在甲狀腺細胞內聚集通過碘化酪氨酸合成單碘酪氨酸、雙碘酪氨酸、三碘酪氨酸、四碘酪氨酸，即甲狀腺激素。而甲狀腺激素是維持人體代謝的興奮性激素，當碘過度缺乏時甲狀腺激素合成的原料減少，此時可導致甲狀腺功能減退癥。此外，甲狀腺激素合成不足時，促甲狀腺激素水平升高。而促甲狀腺激素水平是由下丘腦、垂體所分泌，該激素可讓甲狀腺組織增生、肥大，從而多合成甲狀腺激素，此時容易造成甲狀腺腫大，即俗稱的大脖子病。