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快速病理檢查的準確性不如常規病理診斷，診斷的精細度更是有較大差距，其診斷一般都是判斷性的，能診斷是或者不是，即是腫瘤或不是腫瘤，是良性或惡性。與常規病理診斷相比診斷受限的原因有如下四點： 1、時間有限，一般冰凍報告在30分鐘內要匯報給臨床醫生，導致病理醫生考慮可能不是十分周全； 2、制片效果比較差，質量差的HE切片嚴重影響病理醫生診斷； 3、參與的病理醫生少，一般兩個左右，疑難病理就得不到充分的討論； 4、快速切片取材有限，大多數是取一塊或者兩塊，會加大漏診的可能性。如甲狀腺微小乳頭狀癌在冰凍時經常漏診，幾乎占據冰凍誤診的一半左右，快速冰凍診斷結果正確率通常在95%左右，當然受各家醫院條件的影響，不同醫院的準確率會有所差距。冰凍免疫組化技術的應用，提高了冰凍快速病理診斷的準確率和精確度，也相應延長了冰凍時間，一般用在病變性質冰凍難以確定時加以輔助診斷。總之，快速病理檢查的準確性要低于常規病理診斷。有時候臨床為了盡快得到病理報告，而采用快速冰凍的方式，這樣十分錯誤，加大了病理診斷的漏診或者誤診率。有時取得的標本有限且比較小，冰凍以后沒有相應的常規病理報告，導致最后無法最終確診，對病人十分不利。