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經皮肺穿刺活檢通常在CT引導下進行，絕大部分的病人通過局麻，就可以達到麻醉效果。在CT引導下，確認腫瘤大小、形態，與周圍組織、血管等的關系，評估安全性，明確穿刺范圍，然后使用一次性的穿刺針，沿腫瘤的最大徑與皮膚的投影處為進針點進針。 CT的引導下到達腫瘤中心部位進行取材，然后根據檢測標本的需要多點取材、多次取材。因為除了需要做病理檢測以外，還需要做免疫組化、基因檢測，包括免疫治療的相關一些檢查。 隨著穿刺針數增加，病人的不良反應也會相應增加，比如出血、感染、氣胸等。要求穿刺完畢以后，病人回到病房要臥床休息超過24小時。有合并肺大皰，長期吸煙，肺氣腫等合并癥的病人，臥床時間要求更長，以避免術后出現氣胸。