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食管癌的原因現在還不很清楚，它涉及很多因素，譬如環境因素、遺傳因素，大致總結一下可能跟以下幾方面因素有關： 1、亞硝胺和真菌：飲食和飲水中含有硝酸鹽，真菌可以把硝酸鹽還原成亞硝酸鹽，亞硝酸鹽是一類很重要的強致癌物質，有一些真菌還可以合成亞硝胺； 2、營養因素：在食管癌高發區域，發現缺少動物性蛋白、維生素、微量元素等營養物質，所以這些營養物質的缺乏跟食管癌的發生有關； 3、飲食習慣：食管癌病人常常有大量長期飲酒史、吸煙史或喜食粗糙食物、滾燙食物或進食很快，還有些病人喜歡吃霉變或者腌泡食物； 4、遺傳或基因：食管癌高發區病人常常有家族聚集性，研究發現食管癌病人的染色體數目和結構有變化，另外有些基因改變可以促進食管癌發生； 5、其它因素：食管慢性炎癥、食管反流性炎癥、巴雷特食管、食管腐蝕傷、賁門失弛緩，這些食管的良性疾病長期刺激也有很高的癌變幾率。