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偏頭痛的病因目前還不是很清楚。但遺傳是其中的一個原因。有六成的病人有家族史，雙胞胎的患者如果其中一個患偏頭痛，另外一個可能在一段時間以后也會患偏頭痛。但是，偏頭痛的遺傳方式不是按照孟德爾遺傳方式進行遺傳的，而是多基因和環(huán)境相互作用的結果。偏頭痛還與內(nèi)分泌、代謝等原因有關，比如激素方面，與體內(nèi)自身的激素、女性雌激素的水平、甲狀腺功能有關等。糖尿病病人，高血糖或者低血糖的時候，也可以出現(xiàn)偏頭痛發(fā)作。食物因素，特別是食物添加劑，也與偏頭痛有一定的關系。