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鱗狀上皮內病變的原因有很多，最重要的是在何種部位發生了鱗狀上皮內病變，就女性而言，發生鱗狀上皮內病變更多見的還是來源于宮頸的病變。關于女性宮頸組織，有時可能會因為高危亞型的人乳頭瘤病毒感染，而導致高級別的宮頸上皮內病變，也有可能會出現宮頸的浸潤癌。因此，關于女性在罹患宮頸癌的病因方面，目前已經非常明確，實際上就是高危亞型的人乳頭瘤病毒的持續性感染。人乳頭瘤病毒是一個大家族，有100多種基因亞型，其中有13-15種基因亞型，如果持續性感染，將有可能導致宮頸癌前病變甚至宮頸癌變。這里面的宮頸癌前病變，包括輕級別宮頸的鱗狀上皮內病變和高級別的。但是低級別的宮頸鱗狀上皮內病變，有一部分是高危亞型人乳頭瘤病毒感染所導致，還有一部分可能是由于一些低危亞型的人乳頭瘤病毒感染所導致。因此，也有很多女性患有低級別的宮頸鱗狀上皮內病變的時候，很有可能通過自身的抵抗力、免疫力，即使沒有給予任何治療，也能夠自然轉歸到正常人群。如果是低級別的宮頸鱗狀上皮內病變，只是需要定期隨診，定期去進行宮頸的防癌檢查，甚至進行陰道鏡下的宮頸活檢，目的是為了早期發現、早期治療宮頸高級別的宮頸鱗狀上皮內病變以及早期的浸潤癌。但實際上，絕大多數都能夠自然轉陰。如果是高級別的宮頸鱗狀上皮內病變，其實絕大多數都是由于高危亞型的人乳頭瘤病毒感染所導致。因此，為了預防在未來很可能會發生癌變，大多數在出現高級別病變的時候，至少需要給予宮頸錐切來明確病因，同時切除病灶。