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缺碘常見引起的疾病稱為甲狀腺功能減退，簡稱甲減。因為碘是甲狀腺細胞合成所需的原料，碘缺乏過量會引起原料過少，體內甲狀腺激素水平不足會引起甲狀腺功能減退。但并不一定所有的甲狀腺功能減退均是缺碘引起，碘過量時也會引起甲狀腺功能減退。缺碘并不一定會引起甲狀腺功能變化，比如在50-60年代，是碘缺乏的年代，不常規在食鹽中加碘時，絕大多數人群曾患有碘缺乏所引起大脖子病，對應檢查顯示甲狀腺功能并非有異常。但通過增加碘攝入量，疾病可逐漸治愈。因此，缺碘時需要進行甲狀腺功能檢查，并且進行甲狀腺彩超檢查，如果結果顯示有缺碘引起甲狀腺功能減退，則在補充碘原料時，還要進一步進行補充甲狀腺激素水平的治療。