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γ-谷氨酰轉肽酶是肝功能化驗中的一項主要指標，γ-谷氨酰轉肽酶的升高常代表患者出現肝臟疾病以及膽系疾病。各種原因引起的肝臟炎癥損傷均可以表現為γ-轉肽酶升高，往往伴隨有谷丙轉氨酶和谷草轉氨酶同步升高，包括病毒性肝炎，如乙肝、丙肝等，均可引起轉氨酶以及轉肽酶的升高。但對于部分急性炎癥發作后，在肝臟功能的恢復末期，谷丙轉氨酶和谷草轉氨酶均恢復后，可γ-谷氨酰轉肽酶較難恢復。另外，γ-谷氨酰轉肽酶是酒精性肝病的特異性酶。長期大量飲酒或者酗酒的患者，突出表現為γ-轉肽酶的顯著升高，甚至達到數百上千。此外，部分膽道梗阻性的疾病，包括腫瘤和結石引起的膽道梗阻，γ-轉肽酶也會明顯升高。