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尿液中的鱗狀上皮細胞又叫復層扁平上皮細胞，主要來源于尿道的前段，女性有時尿液中混合有來自陰道的復層扁平上皮細胞。如果尿液中出現大量復層扁平上皮細胞，或者有片狀的脫落復層扁平上皮細胞，同時伴有白細胞和膿細胞，最常見的疾病就是尿道炎。尿液中的上皮細胞檢查分為復層扁平上皮細胞，也就是鱗狀上皮細胞，還有移行上皮細胞和腎小管上皮細胞，腎小管上皮細胞來源于遠曲或者近曲腎小管，如果在尿液中出現腎小管上皮細胞提示有腎小管病變，通常在腎移植術后監測尿液中的腎小管上皮細胞，來觀察是否存在有排斥反應。尿液中的移行上皮細胞共分三大類型，其中表層移行上皮細胞來源于膀胱，中層移行上皮細胞來源于腎盂，底層移行上皮細胞來源于輸尿管、膀胱和尿道，正常人尿液中沒有或者偶爾有移行上皮細胞。在尿液中出現移行上皮細胞，通常見于泌尿系統的感染，如果大量出現，需要警惕移行上皮細胞癌的可能。