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胃腸道間質瘤可在胃腸外科、普通外科或消化腫瘤內科就診。胃腸道間質瘤是起源于胃腸道的間葉腫瘤，最常發生于胃和小腸，隨著腫瘤長大，患者常伴有腹痛、消瘦、貧血、乏力等癥狀，嚴重時還會有黑便、嘔血、胃穿孔、腸梗阻等表現。如果發生以上這種情況，應及時到胃腸外科就診，由醫生判斷是否需要進行手術治療。如果醫院沒有細分的胃腸外科，患者也可以在普通外科就診。如果患者已經出現了腫瘤進展，需要接受靶向藥物治療，也可到消化腫瘤內科就診。消化腫瘤內科在臨床上主要是治療消化道腫瘤的科室，部分醫院可能是腫瘤內科下屬分支亞專科，主要專長于難治性消化系統腫瘤的診斷、藥物治療、綜合治療和個體化治療。目前國內一些三甲醫院，在胃腸外科門診中專門開設胃腸道間質瘤專病門診，為患者就診提供了更為明確的指引。如果患者確診胃腸道間質瘤，可前往專病門診就診。