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BNP半衰期指血中BNP耗時將其中一半從血液中代謝排出，實際只有22分鐘，時間較短。心力衰竭病人心房、心室，由于壓力負荷過重之后，可以分泌出BNP，于血液中存在的時間與半衰期長短有直接關系。半衰期短在血液存在的時間也較短，指半衰期短的物質在血液內檢測，不一定能反映真實水平。BNP是用來診斷與評估有無心衰以及心衰嚴重程度的指標，在癥狀發作后的不同時間段內，測量BNP可能差異較大。由于BNP半衰期時間比較短，隔幾個小時檢測血液的BNP差異較大，所以在BNP的基礎上又找出被稱為NT-proBNP的指標。NT-proBNP是BNP生成過程中，與其1:1比例產生的物質，NT-proBNP的半衰期比較長，是BNP的幾倍。目前用半衰期較長的NT-proBNP作為檢測指標，對于心力衰竭嚴重程度的評估比BNP更加準確。