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女性沙眼衣原體檢測為陽性，通常證明這個女性患有沙眼，相對來說，沙眼為一類比較嚴重的疾病。沙眼衣原體為介于細菌和病毒之間的一種微生物，長期、慢性對患者眼睛進行侵襲和侵害，長時間侵害后對眼睛形成不可逆的變化。沙眼衣原體的發生與生活環境差、不衛生有關，比如洗澡條件不好，工作或者生活條件比較骯臟，在煙熏火燎、風沙、粉塵環境下存在的沙眼衣原體，會反復、不斷對眼睛進行侵襲，可能是從孩子時期開始，由于簡陋的環境，引起眼睛被沙眼衣原體感染。沙眼衣原體主要侵犯的部位是女性結膜和角膜，會對結膜形成大量的砂礫狀乳頭增生，或者乳泡的產生，同時有較多血管翳長入透明角膜上，引起角膜發生潰瘍或者瘢痕化，便導致視力不能看見。在治療過程又比較困難，也沒有特效藥物對沙眼進行完全抑制，尤其是廣大農村生活環境比較差的女性的視力喪失。隨著生活條件的提高，女性抵抗細菌或者病毒能力越提高，同時生活衛生條件的轉好，目前發生沙眼衣原體陽性的女性逐漸減少，一般很難在臨床上看到沙眼這種病變的女性。