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通常做腸鏡后還需做大便常規，腸鏡主要是檢查腸道內是否有黏膜改變，如糜爛、炎癥、充血、水腫、缺血的病變，包括是否有與抗生素相關的偽膜發生，以及是否有腫瘤、息肉，通常息肉屬于良性。腸鏡不能替代大便常規，大便常規可明確腸道的炎癥反應，有時腸鏡下沒有明確的表現，且黏膜正常，但大便常規中出現白細胞、紅細胞，提示有炎癥感染、出血。而且腸鏡檢查結腸，不檢查小腸，小腸鏡能看到不常發現的小腸病變。大便常規提供的信息是一段時期內的大便排便是否異常，不僅是肉眼能看到的異物，還能提供大便性狀、形態，以及是否有白細胞等。而腸鏡提供信息僅為腸鏡檢查時，20-60分鐘內的腸腔改變，所以做腸鏡后，如果出現腹瀉情況，建議做大便常規。