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胸腺切除在臨床上主要針對疾病，比如針對胸腺瘤所進行的手術。如果從出生后胸腺便不存在，也沒有所謂的胸腺切除。而胸腺瘤患者是因為胸腺在出生以后并沒有切除，而是繼續生長，生長為腫瘤，而腫瘤產生對于身體有影響。胸腺本身是T細胞成熟的場所，胸腺瘤的產生使細胞免疫功能增強，產生較多的臨床癥狀，如感染應激提高、細胞因子增高等。所以胸腺切除以后細胞免疫功能會恢復正常，免疫功能會達到平衡。此時胸腺切除是治療疾病的良好手段，對于正常人則不需要做胸腺切除，所以對身體基本沒有任何影響。